孕妇罹患疾病，可影响子宫内的胚胎、胎儿，用药治疗使其尽早痊愈有利于胚胎和胎儿的生长发育，但所用药物有时却对胚胎、胎儿有损害，其损害程度又与用药时的胎龄密切有关。
受精卵着床于子宫内膜前谓之着床前期。此期虽然对药物高度敏感，但如受到药物损害严重，可造成极早期的流产，如若受到部分损害，有时还有补偿功能，胚胎可能继续发育而不发生后遗问题。故如在此期曾短期服用少量药物，不必过分忧虑。关键在于受孕后的3-12周左右，是胚胎、胎儿各器官处于高度分化、迅速发育阶段，药物影响此过程，可能导致某些系统和器官畸形。可见妊娠12周内是致畸最敏感的时期。故此期用药应特别慎重。妊娠4个月以后，胎儿绝大多数器官已形成，药物致畸的敏感性降低，虽然不致造成严重畸形，但对尚未分化完全的器官(如生殖系统)仍有可能受损。神经系统在整个妊娠期间持续分化、发育，故药物的影响一直存在。此外，有些药物对胎儿的致畸不良影响，不表现在新生儿期，而是在若干年后才显示出来。
我们现临床用药遵循FDA（美国食品和药物管理局）的标准，将药物对胎儿的危害等级分为A、B、C、D、X 5个级别。
A 类：对孕妇安全，对胚胎、胎儿无危害。如适量维生素A、B1、B2、C、D、E等。
B 类： 对孕妇比较安全，对胎儿基本无危害。如青霉素、红霉素、胰岛素等。
C 类： 不能除外危害性。仅在动物实验研究时证明对胎儿致畸或可杀死胚胎，未在人类研究证实，孕妇用药需权衡利弊，确认利大于弊时方能应用。如庆大霉素、异烟肼等。
D 类： 对胎儿危害有确切证据，除非用药后有绝对效果，否则不用。如链霉素、四环素等除非万不得已不用。
X 类： 可使胎儿异常，妊娠期禁用。如甲氨蝶呤、已稀雌酚等。
且原则是单药有效的避免联合用药，有疗效肯定的老药避免用尚难确定对胎儿有不良影响的新药，小剂量有效的避免用大剂量。早孕期间避免使用C 、D、X类药物。若病情急需，要应用肯定对胎儿有危害的药物，则应先终止妊娠，再用药。
